Enhanced retention of protein damage during ageing
Abstract
Age can be reset in many different cell types through asymmetric cell division.
During such a division, retention of aging factors in one cell allows the rejuvenation
of the other. In unicellular organisms, it can provide a competitive advantage for the
rejuvenated cell. In multicellular organisms, it is critical for maintenance of a stem
cell lineage. Segregation of damage to the cell committed to differentiation can
promote survival of the stem cell lineage, thereby allowing for long-term regenerative
capacity of tissues that are critical to the organism’s survival.
Asymmetric segregation of damaged proteins requires function of several cellular
systems, many of which have been identified and characterized in the asymmetrically
dividing (budding) yeast, S. cerevisiae, including the components of the actin
cytoskeleton, protein quality control machinery, and intracellular trafficking. Each
gene studied in singularity adds another jigsaw-piece of the big picture that is a
complex cellular machinery of intertwining pathways. Mutations in these cellular
components generally result in reduced asymmetry and often decreased cellular
lifespan. In this study, we focused on one uncharacterized asymmetry generating
gene, YMR074C, and the results indicated a decreased asymmetric segregation
phenotype when knocked-out. Protein aggregates were quantified after exposure to
heat-shock and Hsp104-GFP was used to localize these aggregates. Results confirmed
its involvement in asymmetric protein segregation during mitosis.
Moreover, mutants with enhanced asymmetry have been less characterized,
and the additional purpose of this study was to identify an unknown mutation in a
yeast strain that displayed such enhanced capabilities. To accomplish this, a reverse
PCR strategy was implemented, intending to amplify the nucleotide sequence up- and
downstream from a known resistance marker thought to be linked to the mutation,
thus revealing the affected locus. However, this strategy was unsuccessful and we
could not locate the mutations responsible for the enhanced segregation phenotype.
Degree
Student essay
Other description
Varför åldras vi? Om man kan bygga ett hus från marken och upp, borde det inte då
vara en barnlek att därefter förhindra husets förfall? Varför skulle man inte kunna laga
det man byggt?
Men orsaken bakom åldrande har aldrig varit närmre att bli upptäckt. På
Nyström Lab arbetar man med en jästart, Saccharomyces cerevisiae, för att förstå mer
om hur celler åldras. Det finns nämligen många likheter och flera paralleller att dras
mellan den mänskliga cellen och jäst. Processer som är evolutionärt bevarade mellan
arterna. Genom att studera jästcellen kan man således lära sig mycket om just
åldrande, men även om åldersrelaterade sjukdomar såsom Alzheimer’s, Parkinson’s
m.fl och bakgrunden till deras uppkomst i människan.
Denna studie berör proteiner i cellen. Proteiner bygger upp cellen, dess skelett, olika
beståndsdelar och dess komplexa maskineri, alltid i arbete. Proteiner tillverkas i
cellen, där DNA:t som finns i alla cellkärnor kan betraktas som ritningar. En enskild
ritning, alltså ett enskilt segment av DNA, kallas för en gen. I jästcellen finns ca 8,000
gener, en bråkdel av vad som finns i mänskliga celler. Jag har studerat två olika gener
och jag har valt att kalla dem SPC och YMR i denna text.
Proteiner har en invecklad struktur och en finkänslig sammansättning. Detta innebär
att proteiner kan tillverkas felaktigt, skadas och förstöras. Detta sker kontinuerligt i
cellen och hela tiden omsätter cellen proteiner. Hur skadade proteiner hanteras är
avgörande för dess fortsatta överlevnad och funktionsgrad och en höggradig
uppdamning av skadade proteinaggregat är direkt kopplat till ålderstecken. Särskilt
intressant blir det när jästcellen celldelas, d.v.s knoppar av en bit av sig själv för att
skapa en dottercell. Modercellen kan skapa en asymmetrisk delning av sig själv,
behålla skadliga proteinsamlingar till dottercellens fördel.
YMR är ett protein som vi ännu inte vet mycket om förutom att den är
involverad i den asymmetriska fördelningen av skadade protein mellan moder- och
dottercell. Genom att behandla cellen i ett laboratorium har vi kunnat se att en högre
produktion av YMR förbättrar modercellens förmåga att behålla skadliga proteiner
medan utebliven YMR-produktion markant har försämrat samma aspekt.
SPC upptäktes i en tidigare studie och man uppmärksammade den jäststammens
effektiva asymmetriska nedärvning mellan moder- och dottercell. En okänd mutation
X var orsaken till detta och i denna studie har vi försökt hitta den mutationen.
Projektet var dock fruktlöst trots flertalet försök och frågan kvarstår huruvida
mutation X ligger till grund för cellens särskilda uppförande.